2008年12月24日下午，中国科学院自然科学期刊编辑研究会第四届理事会第二次秘书长办公会议在中关村中国科学院国家科学图书馆第一会议室举行。国家科学图书馆副馆长、期刊研究会秘书长戴利华主持会议，期刊研究会副秘书长沈华、刘培一、肖宏、武文、方梅出席会议，陈辉副秘书长请假。
此次会议的主要议题是：各工作委员会汇报交流计划制定情况； 讨论确定各工作委员会组成人员名单；对研究会下一步工作展开讨论并达成共识。
戴利华秘书长在通报了近期的进展情况后，就期刊研究会工作发表了意见。他在讲话中指出，研究会要结合我院科技期刊的改革与发展开展以研究为主要内容的各项工作，为院出版委提供有效的智力支撑，当好参谋。研究会要有明确定位，有为才能有位；要紧紧围绕我院学术类科技期刊的改革与发展来部署研究会的各项工作；研究会的工作要符合我院广大科技期刊编辑工作者的根本利益；不断创新研究会工作机制，让研究会在合法规范的轨道上运行。办好一刊，建好一网，上下一致，共同奋进。研究会2009年的工作重点是：完成研究会章程的修改；办好一次学术年会；举办两次活动（专题研讨或报告会；主编上岗培训班）；部署并启动一批指令性或指导性专题研究项目或课题；适当调整力量，保质保量如期出版研究会会刊《中国科技期刊研究》；建立健全研究会工作制度和运行机制。
针对计划制定和下一步工作大家展开了热烈的讨论并达成了一些初步的共识：
1、研究会要有一个崭新的面貌，争取做强做好。
2、研究会要针对热点问题展开研究，争取形成政策和措施。如版面费问题、学术年会选题、编辑职称评选资格与标准、期刊质量体系规范、稳定编辑出版人才队伍、以怎样的策略进入大型期刊数据库、公益性期刊的发展战略、设立中国科学院编辑出版研究项目和专项基金等。
3、活动不在于多而在于精，要充分发挥各工作委员会的作用。
4、各工作委员会组成人员的遴选要在自愿的基础上，从如何更能够促进各专项工作有效开展的角度出发，不局限于理事，可在全院科技期刊编辑出版人员中产生。
5、加强研究会平台建设工作，利用挂靠单位的技术力量和各界已开发的系统建设研究会的门户网站。
6、《中国科技期刊研究》杂志稿源丰富、主题覆盖面广，文章质量高，要进一步加强杂志编辑流程、印刷和版式设计的现代化。
7、建立健全研究会的会员管理制度、研究会标识系统。
8、研究设立中国科学院科技期刊优秀编辑工作者的相关奖项。
院出版委办公室主任、期刊研究会副秘书长沈华在讲话中指出，期刊研究会的绝大部分工作都属于兼职性质，大家是一种奉献。本届的各项工作要在承前启后、继往开来的框架下不断创新发展，做好各项计划，发挥广大编辑出版人员的力量，上下结合，共同推进。各工作委员会要尽快提出2009年的工作计划。研究会要更多地关注科技期刊编辑工作职业化问题、“十二·五”编辑出版工作重点的预研问题、有序推进规范化管理问题、期刊审读问题等。研究会挂靠单位的调整进一步理顺了与主管部门的关系，进一步明确了权利与职责，对于期刊研究会的持续健康发展具有重要的推动作用。
会议商定，研究会各工作委员会2009年的工作计划在2008年12月31日前提交研究会秘书处。